Por padrão, uma nota fiscal é emitida na prefeitura e encaminhada ao cliente automaticamente sempre que uma venda passar da garantia de 30 dias.
Independentemente de como sua garantia está configurada na Hotmart.
Esse comportamento se aplica a qualquer venda de qualquer produto, inclusive às vendas como afiliado.
Você precisa acessar o eNotas externo para mudar esse ajuste (veja aqui como)
Você pode mudar isso no App Hotmart a partir do painel do eNotas, veja:
1 - Acesse o marketplace de Apps
2 - Edite o App Hotmart
3 - Altere a configuração de garantia e responda às perguntas exibidas
4 - Escolha a opção SIM

5 - Escolha SIM se desejar replicar o novo prazo de garantia para as vendas que ainda estão em garantia.

6 - Escolha a quantidade de dias que deseja dar de garantia.

Importante
Vendas relativas à produtos que tiverem a garantia personalizada individualmente não serão afetadas pela mudança da garantia padrão.